Changing of hepatitis C virus genotype patterns in France at the beginning of the third millenium: The GEMHEP GenoCII Study
C. Payan
,
F. Roudot-Thoraval
(1)
,
P. Marcellin
(2)
,
N. Bled
,
G. Duverlie
,
I. Fouchard-Hubert
,
P. Trimoulet
(3)
,
P. Couzigou
,
D. Cointe
,
C. Chaput
,
C. Henquell
(4)
,
A. Abergel
,
J. M. Pawlotsky
,
C. Hezode
(5)
,
M. Coudé
,
A. Blanchi
,
Sophie Alain
(6, 7)
,
Véronique Loustaud-Ratti
(6, 8)
,
P. Chevallier
,
C. Trepo
,
V. Gerolami
,
I. Portal
,
P. Halfon
(9)
,
M. Bourlière
(10)
,
M. Bogard
,
E. Plouvier
,
C. Laffont
,
G. Agius
,
C. Silvain
,
V. Brodard
,
G. Thiefin
,
C. Buffet-Janvresse
,
G. Riachi
,
F. Grattard
,
T. Bourlet
,
F. Stoll-Keller
(11)
,
M. Doffoel
(12)
,
Jacques Izopet
,
K. Barange
,
M. Martinot-Peignoux
,
M. Branger
,
A. Rosenberg
,
P. Sogni
,
Marie-Laure Chaix
(13)
,
S. Pol
(14)
,
Valérie Thibault
,
P. Opolon
,
A. Charrois
,
L. Serfaty
(15)
,
B. Fouqueray
,
J. D. Grange
,
J. J. Lefrère
,
F. Lunel-Fabiani
1
Service de santé publique [Mondor]
2 Service d'hépatologie
3 Service de virologie et d'immunologie biologique
4 CHU Clermont-Ferrand
5 Service d'hépato-gastro-entérologie [APHP Henri Mondor]
6 EA3175 - Biologie moléculaire et cellulaire des microorganismes
7 UNILIM - Université de Limoges
8 Service de Bactériologie, Virologie, Hygiène [CHU Limoges]
9 Laboratoire alphabio
10 Service d'Hépato-gastroentérologie
11 Interaction virus-hôte et maladies du foie
12 Service d'hépato-gastroentérologie
13 Laboratoire de Virologie [CHU Necker]
14 Service d'hépatologie médicale [CHU Cochin]
15 CHU Saint-Antoine [AP-HP]
2 Service d'hépatologie
3 Service de virologie et d'immunologie biologique
4 CHU Clermont-Ferrand
5 Service d'hépato-gastro-entérologie [APHP Henri Mondor]
6 EA3175 - Biologie moléculaire et cellulaire des microorganismes
7 UNILIM - Université de Limoges
8 Service de Bactériologie, Virologie, Hygiène [CHU Limoges]
9 Laboratoire alphabio
10 Service d'Hépato-gastroentérologie
11 Interaction virus-hôte et maladies du foie
12 Service d'hépato-gastroentérologie
13 Laboratoire de Virologie [CHU Necker]
14 Service d'hépatologie médicale [CHU Cochin]
15 CHU Saint-Antoine [AP-HP]
C. Payan
- Fonction : Auteur
- PersonId : 881482
- ORCID : 0000-0001-7321-4593
N. Bled
- Fonction : Auteur
G. Duverlie
- Fonction : Auteur
- PersonId : 903128
- IdRef : 069695091
I. Fouchard-Hubert
- Fonction : Auteur
P. Couzigou
- Fonction : Auteur
D. Cointe
- Fonction : Auteur
C. Chaput
- Fonction : Auteur
A. Abergel
- Fonction : Auteur
J. M. Pawlotsky
- Fonction : Auteur
M. Coudé
- Fonction : Auteur
A. Blanchi
- Fonction : Auteur
Sophie Alain
- Fonction : Auteur
- PersonId : 833218
Véronique Loustaud-Ratti
- Fonction : Auteur
- PersonId : 862090
P. Chevallier
- Fonction : Auteur
C. Trepo
- Fonction : Auteur
V. Gerolami
- Fonction : Auteur
I. Portal
- Fonction : Auteur
M. Bogard
- Fonction : Auteur
E. Plouvier
- Fonction : Auteur
C. Laffont
- Fonction : Auteur
G. Agius
- Fonction : Auteur
C. Silvain
- Fonction : Auteur
- PersonId : 762366
- ORCID : 0000-0002-0712-8491
V. Brodard
- Fonction : Auteur
G. Thiefin
- Fonction : Auteur
C. Buffet-Janvresse
- Fonction : Auteur
G. Riachi
- Fonction : Auteur
F. Grattard
- Fonction : Auteur
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T. Bourlet
- Fonction : Auteur
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- IdRef : 074459554
Jacques Izopet
- Fonction : Auteur
- PersonId : 857751
- ORCID : 0000-0002-8462-3234
- IdRef : 058353887
K. Barange
- Fonction : Auteur
M. Martinot-Peignoux
- Fonction : Auteur
M. Branger
- Fonction : Auteur
A. Rosenberg
- Fonction : Auteur
P. Sogni
- Fonction : Auteur
Valérie Thibault
- Fonction : Auteur
P. Opolon
- Fonction : Auteur
A. Charrois
- Fonction : Auteur
B. Fouqueray
- Fonction : Auteur
J. D. Grange
- Fonction : Auteur
J. J. Lefrère
- Fonction : Auteur
F. Lunel-Fabiani
- Fonction : Auteur
Résumé
This cross-sectional study aimed to investigate, during a short period between 2000 and 2001, in a large population of patients with chronic hepatitis C, the epidemiological characteristics of hepatitis C virus (HCV) genotypes in France. Data from 26 referral centres, corresponding to 1769 patients with chronic hepatitis C were collected consecutively during a 6-month period. HCV genotyping in the 5'-non-coding region (NCR) was performed in each center using the line probe assay (LiPA, in 63% of cases), sequencing (25%) or primer-specific polymerase chain reaction (PCR) (12%). HCV genotypes 1a, 1b, 2, 3, 4, 5, non-subtyped 1 and mixed infection were found in 18, 27, 9, 21, 9, 3, 11 and 1% of our population, respectively. HCV genotype distribution was associated with gender, age, source and duration of infection, alanine aminotransferase (ALT) levels, cirrhosis, alcohol consumption, hepatitis B virus (HBV) and human immunodeficiency virus (HIV) coinfection. In multivariate analysis, only the source of infection was the independent factor significantly associated with genotype (P = 0.0001). In conclusion, this study shows a changing pattern of HCV genotypes in France, with i.v. drug abuse as the major risk factor, an increase of genotype 4, and to a lesser extent 1a and 5, and a decrease of genotypes 1b and 2. The modification of the HCV genotype pattern in France in the next 10 years may require new therapeutic strategies, and further survey studies.